Misyon: Bitki Koruma Bölümü, bilimsel değerleri prensip edinen, bilim ve teknolojiden yararlanarak, ülke tarım sektöründe bitkisel yetiştiricilikte sorun olan hastalık etmenleri, yabancı otlar ve zararlıların teşhisi, zarar şekli ve mücadele yöntemleri konularında güncel gelişmeleri ve mühendislik bakış açısıyla çözebilen, bilgi üretip bunu paylaşan ve mesleki etik kurallarına saygılı mühendis ve araştırmacılar yetiştirmeyi, bilimsel araştırma, eğitim ve hizmet alanlarındaki birikimini ve üretimini toplumun yararına sunmayı başlıca görev edinmektir.
Vizyonu: Bitki Koruma Bölümü öğretim üyeleri geçmişten günümüze kadar bitki hastalık, yabancı otlar ve zararlıları ile mücadele konularında, yeni ürünlerin patenti konularında tam donanımlı Ziraat mühendisleri yetiştirmek. Aynı zamanda tarımın paydaşları olan Ziraat mühendisleri, Bitkisel üreticiler, kamu kurumları ile Üniversitelerin ilgili bölüm öğretim üyeleriyle bilgi paylaşımında bulunmaktır. Bitki hastalıkları, yabancı otlar ve zararlılar ile mücadelede son yöntemleri, mesleki etik kurallarına saygılı Ziraat mühendisleri ve araştırmacılar yetiştirmeyi, bilimsel araştırma, eğitim ve hizmet alanlarındaki birikimini ve üretimini toplumun yararına sunmayı başlıca vizyon edinmiştir.